小規模企業共済

　この制度は直接会社の税金とは関係ないですが中小企業の節税としてはメジャーです。
社長個人の退職金の積み立てと思ってください。

しかも払った金額が社長個人の所得から全額控除となります。つまり払った金額が社会保険みたいに全額控除しながら自分の将来のために積み立て出来ます。

かつ、将来退職金として受け取ると退職所得となるので税金が非常に安い。
個人の所得税を節税しながら将来の退職金を積み立て、かつ受け取る時も節税。

細かいことは中小企業基盤整備機構 http://www.smrj.go.jp/skyosai/ 参照